В 331 году до нашей эры царь Македонии Александр Великий приказал разобрать зиккурат и реконструировать его, но в процессе этого великий храм был разрушен. Произойти это могло по нескольким причинам. Одна из главных — довольно хрупкий конструкционный материал, из которого было создано сооружение. Тогда зиккураты строили из обожженного на солнце кирпича — самана.
Саман делали из глины и соломы, но из-за того, что блоки не обжигали в печи, они оставались достаточно хрупкими. Поэтому при сооружении зданий высотой более трех этажей вероятность их обрушения возрастала. Спасти от этого могло более широкое основание, но и оно оказалось недостаточно крепкой опорой, чтобы удерживать вес Этеменанки высотой 90 метров. Согласно современным исследованиям, зиккурат Этеменанки с семью террасами, просто нельзя было сделать из необожженного кирпича. Максимально возможная высота сооружения была около 66 метров, и тогда оно имело бы шесть террас и верхний ярус высотой 12 метров. Историки допускают такое положение дел, учитывая древность сооружения и точность, с которой люди того времени могли оценивать высоту зданий.